Il nuovo assetto dell’AdSP prevede una governance più snella rispetto al passato e più orientata all’efficienza operativa. In questa nuova ottica il Comitato di gestione, profondamente razionalizzato nella composizione rispetto agli ex Comitati portuali al fine di velocizzare i processi decisoionali, costituisce il board delle nuove Adsp ed è deputato ad approvare gli atti di programmazione e gestione presentati dal Presidente.  Il Comitato è presieduto dal Presidente e composto dai rappresentati della Capitaneria di porto, della Regione, della Città metropolitana e degli Enti locali.
Si riunisce di norma ogni due mesi e, comunque, su convocazione del Presidente e ogni qualvolta lo richieda un terzo dei componenti; per la validità delle sedute è richiesta la presenza della metà più uno dei componenti. Il Comitato adotta un regolamento per disciplinare lo svolgimento delle sue attività.

Competenze del Comitato di Gestione, di cui all’art.9 comma 5 L. Legge n. 84/1994 e ss.mm.ii: 

• Adotta il documento di pianificazione strategica di sistema, il piano regolatore portuale e gli adeguamenti tecnico-funzionali di cui all’art. 5, comma 5;
• approva il piano operativo triennale, soggetto a revisione annuale, concernente le strategie di sviluppo delle attività portuali e logistiche;
• approva il bilancio di previsione, le note di variazione e il conto consuntivo;
• predispone, su proposta del Presidente, il regolamento di amministrazione e contabilità dll’AdSP;
• approva la relazione annuale sull’attività dell’AdSP da inviare al Ministero delle Infrastrutture e dei Trasporti;
• esprime i pareri di cui all’art. 8, comma , lettere f),m),n) e q) e di cui all’art. 6-bis, lettea c-bis);
• delibera, su proposta del Presidente, in ordine alle autorizzazioni e alle concessioni di cui agli art 6, comma 10, 16, e 18 di durata superiore a quattro anni determinando l'ammontare dei relativi canoni;
• delibera la dotazione organica dell’AdSP;
• delibera il recepimento delgi accordi contrattuali relativi al personale dell’AdSP e gli strumenti di valutazione dell’efficacia, della trasparenza, del buon andamento della gestione dell’AdSP;
• nomina il Segretario generale su proposta del Presidente dell’AdSP;
• delibera il piano dell’organico del porto dei lavoratori delle imprese di cui agli articoli 16, 17 e 18 della legge 84/94 

Gli interessi sociali ed economici portuali e il prezioso punto di vista degli stakeholders trovano espressione nel nuovo organismo di partenariato, istituito con il D.Lgs 169/2016, attraverso la formulazione di pareri sui principali provvedimenti della gestione, tra i quali, in particolare, il Piano operativo triennale (Pot), che delinea le strategie di sviluppo delle attività portuali e il Piano regolatore portuale (Prp), che determina la destinazione d’uso delle aree, i bilanci preventivi e consuntivi. 

L’Organismo, di cui all’art. 11-bis del D.Lgs 169/2016, ha funzioni di confronto partenariale ascendente e discendente, nonché funzioni consultive di partenariato economico sociale, in particolare in ordine:
a) all’adozione del piano regolatore di sistema portuale;
b) all’adozione del piano operativo triennale;
c) alla determinazione dei livelli dei servizi resi nell’ambito del sistema portuale dell’AdSP suscettibili di incidere sulla complessiva funzionalità ed operatività del porto;
d) al progetto di bilancio preventivo e consuntivo.